Analiza datelor Rna-Seq: O abordare practică

Recenzii ale cititorilor

Această carte este foarte apreciată pentru introducerea detaliată a tehnologiei RNAseq, ceea ce o face ideală pentru începători și educatori în bioinformatică. Ea acoperă aplicațiile practice în mod cuprinzător, include instrucțiuni de linie de comandă și oferă exemple din viața reală pentru a facilita învățarea. Cu toate acestea, unii utilizatori au remarcat probleme legate de disponibilitatea datelor de pe site-urile recomandate și au considerat că anumite aspecte tehnice, în special cele legate de R, au fost subreprezentate.

⬤ Foarte practic și cuprinzător
⬤ excelent pentru începători
⬤ include instrucțiuni pas cu pas și exemple reale
⬤ bun pentru predare
⬤ autonom și acoperă diverse instrumente și metode RNAseq.

⬤ Unele seturi de date nu au putut fi accesate
⬤ este posibil să nu acopere toate instrumentele relevante
⬤ secțiune subreprezentată privind R
⬤ mai orientată către bioinformaticieni decât către cercetătorii din laboratoarele umede.

(pe baza a 15 recenzii ale cititorilor)

Titlul original:

Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach

Conținutul cărții:

Stadiul actual al analizei transcriptomului Datele de secvențiere a ARN (ARN-seq) oferă informații fără precedent despre transcriptom, însă valorificarea acestor informații cu ajutorul instrumentelor bioinformatice reprezintă de obicei un blocaj. Analiza datelor ARN-seq: o abordare practică permite cercetătorilor să examineze expresia diferențială la nivel de genă, exon și transcripție și să descopere noi gene, transcripții și transcriptomi întregi.

Acoperire echilibrată a teoriei și practicii. Fiecare capitol începe cu contextul teoretic, urmat de descrieri ale instrumentelor de analiză relevante și exemple practice. Accesibile atât bioinformaticienilor, cât și cercetătorilor din laboratoarele umede neprogramatoare, exemplele ilustrează utilizarea instrumentelor de linie de comandă, R și a altor instrumente open source, cum ar fi software-ul grafic Chipster.

Instrumentele și metodele pentru a începe în laboratorul dvs. Conducând cititorii prin întregul flux de lucru de analiză a datelor, acest ghid de sine stătător oferă o prezentare detaliată a principalelor metode de analiză a datelor ARN-seq și explică modul de utilizare a acestora în practică. Este potrivit pentru cercetători dintr-o mare varietate de medii, inclusiv biologie, medicină, genetică și informatică. Cartea poate fi, de asemenea, utilizată în cadrul unui curs universitar sau de licență avansată.