Biologie cantitativă: Teorie, metode computaționale și modele

Recenzii ale cititorilor

În prezent, nu există recenzii ale cititorilor. Evaluarea se bazează pe 9 voturi.

Titlul original:

Quantitative Biology: Theory, Computational Methods, and Models

Conținutul cărții:

O introducere în modelarea cantitativă a proceselor biologice, prezentând abordări de modelare, metodologie, algoritmi practici, instrumente software și exemple de cercetare actuală.

Modelarea cantitativă a proceselor biologice promite să extindă cercetarea biologică de la o știință a observației și descoperirii la una a predicției riguroase și a analizei cantitative. Domeniul în creștere rapidă al biologiei cantitative încearcă să utilizeze capacitățile tehnologice și computaționale emergente ale biologiei pentru a modela procesele biologice. Acest manual oferă o introducere în teoria, metodele și instrumentele biologiei cantitative.

Cartea prezintă mai întâi bazele modelării biologice, concentrându-se pe unele dintre cele mai utilizate formalisme. Apoi prezintă metodologia esențială pentru analizele datelor biologice ghidate de model, acoperind metode precum reconstrucția rețelei, cuantificarea incertitudinii și proiectarea experimentală; algoritmi practici și pachete software pentru modelarea sistemelor biologice; și exemple specifice de cercetare biologică cantitativă actuală și metode specializate conexe. Majoritatea capitolelor oferă probleme, progresând de la simplu la complex, care testează stăpânirea de către cititor a unor tehnici cheie precum simulările deterministe și stocastice și analiza datelor. Multe capitole includ fragmente de cod care pot fi utilizate pentru a recrea analize și a genera figuri legate de text. Exemplele sunt prezentate în cele trei limbaje de calcul populare: Matlab, R și Python. O varietate de resurse online completează textul.

Editorii sunt organizatori de lungă durată ai Școlii anuale de vară q-bio, care a fost fondată în 2007. Prin intermediul școlii, editorii au contribuit la formarea a peste 400 de studenți invitați în Los Alamos, NM, Santa Fe, NM, San Diego, CA, Albuquerque, NM și Fort Collins, CO. Această carte este inspirată de programele școlii, iar majoritatea colaboratorilor au participat la școală în calitate de studenți, lectori sau ambele.

Colaboratori.

John H. Abel, Roberto Bertolusso, Daniela Besozzi, Michael L. Blinov, Clive G. Bowsher, Fiona A. Chandra, Paolo Cazzaniga, Bryan C. Daniels, Bernie J. Daigle, Jr, Maciej Dobrzynski, Jonathan P. Doye, Brian Drawert, Sean Fancer, Gareth W. Fearnley, Dirk Fey, Zachary Fox, Ramón Grima, Andreas Hellander, Stefan Hellander, David Hofmann, Damian Hernandez, William S. Hlavacek, Jianjun Huang, Tomasz Jetka, Dongya Jia, Mohit Kumar Jolly, Boris N. Kholodenko, Markek Kimmel, Michal Komorowski, Ganhui Lan, Heeseob Lee, Herbert Levine, Leslie M Loew, Jason G. Lomnitz, Ard A. Louis, Grant Lythe, Carmen Molina-Par s, Ion I. Moraru, Andrew Mugler, Brian Munsky, Joe Natale, Ilya Nemenman, Karol Nienaltowski, Marco S. Nobile, Maria Nowicka, Sarah Olson, Alan S. Perelson, Linda R. Petzold, Sreenivasan Ponnambalam, Arya Pourzanjani, Ruy M. Ribeiro, William Raymond, Herbert M. Sauro, Michael A. Savageau, Abhyudai Singh, James C. Savageau, Abhyudai Singh. Schaff, Boris M. Slepchenko, Thomas R. Sokolowski, Petr Sulc, Andrea Tangherloni, Pieter Rein ten Wolde, Philipp Thomas, Karen Tkach Tuzman, Lev S. Tsimring, Dan Vasilescu, Margaritis Voliotis, Lisa Weber.