Cryoem: Metode și protocoale

Titlul original:

Cryoem: Methods and Protocols

Conținutul cărții:

Partea I - Criotomografie electronică

1. Noțiuni introductive privind tomografia crioelectronică in situ.

Daniel Serwas și Karen M. Davies.

2. Tomografia crioelectronică și segmentarea automată a neuronilor hipocampali cultivați.

Ryan K. Hylton, Victoria H. Seader și Matthew T. Swulius.

3. Abordări practice pentru frezarea Cryo-FIB și aplicații pentru tomografia crioelectronică celulară.

Vinson Lam și Elizabeth Villa.

4. Imagistica in situ și determinarea structurii complexelor biomoleculare cu ajutorul tomografiei crioelectronice.

Mohammed Kaplan, William J Nicolas, Wei Zhao, Stephen D Carter, Lauren Ann Metskas, Georges Chreifi, Debnath Ghosal și Grant J. Jensen.

Partea II - Analiza particulelor unice și criomicroscopia electronică

5. Progrese către CryoEM: proceduri de colorare negativă pentru probe biologice.

Shane Gonen.

6. Configurarea iluminării paralele pe Talos Arctica pentru colectarea de date de înaltă rezoluție.

Mark A. Herzik, Jr.

7. Rafinarea multi-corp a imaginilor crio-EM în RELION.

Takanori Nakane și Sjors H. W. Scheres.

8. Evaluarea rezoluției locale și direcționale a hărților de densitate crio-EM.

Sriram Aiyer, Cheng Zhang, Philp R. Baldwin și Dmitry Lyumkis.

9. Modelarea și validarea automată a complexelor proteice în hărțile crio-EM.

Tristan Cragnolini, Aaron Sweeney și Maya Topf.

10. Cristalografie electronică 2D a rețelelor ordonate de proteine membranare cu strat unic, dublu și multistrat.

Matthew C. Johnson, Yusuf M. Uddin, Kasahun Neselu și Ingeborg Schmidt-Krey.

Partea III-Cristalografia electronică a cristalelor 2d

11. Pregătirea probelor și colectarea datelor pentru studiile cristalografice electronice privind structurile proteinelor membranare și interacțiunea lipide-proteine.

Ka-Yi Chan, Chloe Du Truong, Yu-Ping Poh și Po-Lin Chiu.

12. Analiza particulelor unice pentru cristalografia electronică 2D de înaltă rezoluție.

Ricardo Righetto și Henning Stahlberg.

13. Pregătirea probelor MicroED și colectarea datelor pentru cristale de proteine.

Guanhong Bu și Brent L. Nannenga.

PARTEA IV - DIFRACȚIA ELECTRONICĂ A MICROCRISTALELOR (MICROED)

14. Detectarea microcristalelor pentru CryoEM.

Simon Weiss, Sandra Vergara, Guowu Lin și Guillermo Calero.

15. Colectarea de date cu doze mici și deteriorarea prin radiații în MicroED.

Johan Hattne.

16. Automatizarea colectării de date în rotație continuă pentru MicroED.

M. Jason de la Cruz.

17. Determinarea ab initio a structurilor peptidice prin MicroED.

Chih-Te Zee, Ambarneil Saha, Michael R. Sawaya și Jose A. Rodriguez.