Fosfoproteomica plantelor: Metode și protocoale

Titlul original:

Plant Phosphoproteomics: Methods and Protocols

Conținutul cărții:

1.Motive ale situsului de fosforilare în proteinele kinaze vegetale și substraturile lor

Lin Xi, Zhaoxia Zhang, Sandra Herold, Sarah Kassem, Xu Na Wu și Waltraud X. Schulze.

2. Răspunsul fosforilării proteinelor la stresul abiotic în plante

Rebecca Njeri Damaris și Pingfang Yang.

3. Fosforilarea proteinelor în semnalizarea celulelor vegetale

Ping Li și Junzhong Liu.

4. Profilul fosfoproteomic al mutanților receptorilor kinazei

Dandan Lu, Ting Gao, Lin Xi, Leonard Krall și Xu Na Wu.

5. Analiza fosfoproteomică a rădăcinilor de soia în condiții de salinitate prin utilizarea abordării de etichetare iTRAQ

Yuchen Qian, Jia Xu și Erxu Pi.

6. Flux de lucru universal de pregătire a probelor pentru analiza fosfoproteomică a plantelor

Chuan-Chih Hsu, Justine V. Arrington și W. Andy Tao.

7. Cartografierea fosfoproteomului plantelor cu MOAC în tandem îmbunătățit și cuantificare fără etichetă

Yanmei Chen și Xinlin Liang.

8. Proteomică PTM cantitativă 4C bazată pe SILIA

Emily Oi Ying Wong și Ning Li.

9. Analiza fosfoproteomică a țesutului radicular al plantelor

Zhe Zhu, Shubo Yang, Shalan Li, Xiaolin Yang și Leonard Krall.

10. Îmbogățirea fosfopeptidelor vegetale prin cromatografie de afinitate cu ioni metalici imobilizați

Xiahe Huang, Yuanya Zhang, Haitao Ge, Dandan Lu și Yingchun Wang.

11. Electroforeza bidimensională pe gel și fosfoproteomica plantelor bazată pe colorarea fosfoproteică Pro-Q Diamond

Yuan Li și Dongtao Ren.

12. DIGE 2-D combinat cu colorarea Pro-Q Diamond pentru identificarea fosforilării proteinelor pentru Chlamydomonas reinhardtii : o abordare de succes

Li Li.

13. Identificarea fosfopeptidelor vegetale și cuantificarea fără etichetă prin MaxQuant și Proteome Discovery Software

Shalan Li, Haitao Zan, Zhe Zhu, Dandan Lu și Leonard Krall.

14. Phosphat 4. 0: O bază de date Arabidopsis actualizată pentru căutarea siturilor de fosforilare și a interacțiunilor kinază-țintă

Lin Xi, Zhaoxia Zhang și Waltraud X. Schulze.

15. Reconstrucția computațională a rețelei de fosforilare: O actualizare privind metodele și resursele

Min Zhang și Guangyou Duan.

16. Aplicarea unei platforme bazate pe limbajul R cRacker pentru analiza datelor fosfoproteomice

Mingjie He și Zhi Li.

17. Testarea activității kinazei utilizând substrat nespecific sau peptide sintetice specifice

Jiahui Wang, Xiaolin Yang, Lin Xi și Xu Na Wu.