Genuri și genomuri esențiale: Metode și protocoale

Titlul original:

Essential Genes and Genomes: Methods and Protocols

Conținutul cărții:

1. O metodă de cartografiere a esențialității genice a celulelor stem pluripotente umane prin ecrane CRISPR la scară genomică cu Cas9 inductibil

Barbara Mair, Michael Aregger, Amy H. Y. Tong, Katherine S. K. Chan și Jason Moffat.

2. Screening CRISPR/Cas9 pentru identificarea genurilor esențiale condiționate în liniile celulare umane

Kimberly S. Huggler, Nicholas J. Rossiter, Kyle M. Flickinger și Jason R. Cantor.

3. Identificarea țintelor moleculelor mici utilizând scanarea mutagenică CRISPR-Cas pe scară largă a genurilor esențiale

Bert Kwanten, Jasper Neggers și Dirk Daelemans.

4. Proiectarea și generarea unui sistem de interferență CRISPR pentru reprimarea genetică și analiza genelor esențiale în patogenul fungic Candida albicans

Lauren Wensing și Rebecca S. Shapiro.

5. Identificarea genelor esențiale folosind CRISPR secvențial și siRNA Screens

Luke DeHart, Oliver P. Yockey și Jesse Bakke.

6. O metodă simplă care combină CRISPR și AID pentru a genera rapid Knockouts condiționate pentru genuri esențiale în diferite linii celulare de vertebrate

Kohei Nishimura și Tatsuo Fukagawa.

7. Metodă nouă pentru studiul genomicii funcționale la scară genomică în bacterii cu performanțe superioare: CRISPR Interference Screen

Xihao Liao, Xin-Hui Xing și Chong Zhang.

8. O metodă bazată pe CRISPR pentru construirea mutațiilor condiționate ale genurilor esențiale în cianobacterii

Ju-Yuan Zhang, Tian-Cai Niu, Gui-Ming Lin și Cheng-Cai Zhang.

9. O metodă de secvențiere prin inserție de transpozoni în identificarea cuprinzătoare a genurilor Vibrio vulnificus necesare pentru creșterea în serul uman

Miguel Carda-Diguez și Carmen Amaro.

10. Utilizarea Tn-Seq și analiza FiTnEss pentru a defini genomul esențial de bază al Pseudomonas aeruginosa

Bradley E. Poulsen, Anne E. Clatworthy și Deborah T. Hung.

11. Analiza genurilor de virulență ale Escherichia coli K1 prin secvențiere dirijată de transpozon

Alex J. McCarthy și Peter W. Taylor.

12. Utilizarea bibliotecilor de mutanți la scara genomului pentru identificarea genurilor esențiale

Kevin S. Myers, Piyush Lal, Daniel R. Noguera și Timothy J. Donohue.

13. Identificarea și analiza genurilor esențiale din Streptococcus mutans cu ajutorul secvențierii transpozonilor

Alejandro R. Walker și Robert C. Shields.

14. Utilizarea TnSeq pentru identificarea genurilor esențiale ale alfaproteobacteriilor dezvăluie variabilitatea operațională în sistemele conservate de dezvoltare și ciclu celular

Gayatri Sharma și Patrick D. Curtis.

15. Un cadru propus pentru identificarea funcțiilor dispensabile și esențiale în Bifidobacteria: Studiu de caz al Bifidobacterium breve UCC2003 ca prototip al genului său