Identificarea in silico des micrornas et de leurs cibles chez la lentille

Titlul original:

Identification in silico des micrornas et de leurs cibles chez la lentille

Conținutul cărții:

În această lucrare, este adoptată abordarea in silico pentru identificarea și caracterizarea miARN-urilor conservate în etichetele de secvențe exprimate (EST) ale lintei. Pentru identificarea de miARN-uri noi în linte, secvențele EST au fost căutate pentru omologie cu miARN-uri mature cunoscute din regnul vegetal Viridiplantae utilizând BLASTN online.

Identificarea computațională bazată pe genomică comparativă a produs 12 potențiali candidați miARN aparținând la 12 familii diferite de miARN în cristalin. În cele din urmă, folosind potențialele miARN-uri din cristalin, au fost prezise un total de 25 de gene țintă și au fost ilustrate funcțiile lor probabile.

Cele mai multe dintre genele țintă ale miARN-urilor de cristalin par să codifice creșterea, dezvoltarea, metabolismul și răspunsul la stres, rezistența la boli și așa mai departe. În viitorul apropiat, o mai bună înțelegere a mecanismelor moleculare ale miARN-urilor în planta lintei ar putea contribui la dezvoltarea unei tehnici noi și precise pentru înțelegerea anumitor mecanisme post-transcripționale de reducere la tăcere a genelor ca răspuns la toleranța la stres.