Statistică și analiza datelor pentru microarrays utilizând R și Bioconductor

Recenzii ale cititorilor

Cartea este un ghid cuprinzător privind analiza microarray, programarea R și tehnicile statistice aplicabile genomicii. Este bine scrisă, cu explicații clare și un stil de predare captivant, făcând subiectele complexe accesibile cititorilor din diverse medii. Deși servește ca o resursă excelentă atât pentru începători, cât și pentru practicienii experimentați, unele recenzii indică o lipsă de profunzime în anumite domenii, în special în ceea ce privește analiza Bioconductor și RNA-seq.

Cartea este completă, bogată în conținut și foarte ușor de citit. Ea servește ca o referință excelentă atât pentru începători, cât și pentru cititorii experimentați, acoperind subiecte esențiale în biologie, statistică și programare R. Autorul este remarcat pentru abilitățile sale didactice și utilizarea umorului, precum și pentru includerea ilustrațiilor color care ajută la înțelegerea conceptelor complexe. Mulți cititori apreciază explicațiile detaliate și perspectivele practice ale autorului, făcând din această carte o resursă inestimabilă pentru bioinformatică.

Unii cititori au considerat cartea uneori dificil de urmărit, în special din cauza capitolelor lungi privind statisticile de bază și programarea R. Au existat critici cu privire la informațiile insuficiente privind Bioconductor și analiza datelor microarray, ceea ce i-a determinat pe unii să considere că era necesară o înțelegere de bază. În plus, mai multe recenzii au menționat redundanța în explicațiile statistice de bază și o lipsă percepută de profunzime în analiza RNA-seq.

(pe baza a 18 recenzii ale cititorilor)

Titlul original:

Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor

Conținutul cărții:

Bogat ilustrat în culori, Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor, Second Edition oferă o descriere clară și riguroasă a tehnicilor și algoritmilor de analiză puternici pentru extragerea și interpretarea informațiilor biologice. Omițând detaliile plictisitoare, formalismele grele și notațiile criptice, textul adoptă o abordare practică, bazată pe exemple, care îi învață pe studenți noțiunile de bază ale R și ale tehnologiei microarray, precum și modul de alegere și aplicare a instrumentului adecvat de analiză a datelor la probleme specifice.

Nou în cea de-a doua ediție.

Complet actualizată și de două ori mai mare decât predecesoarea sa, această a doua ediție oportună înlocuiește software-ul comercial cu mediile open source R și Bioconductor. Paisprezece capitole noi acoperă subiecte precum mecanismele de bază ale celulei, probleme de fiabilitate și reproductibilitate în microarrays ADN, statistici de bază și modele liniare în R, proiectarea experimentelor, comparații multiple, controlul calității, preprocesarea și normalizarea datelor, analiza Ontologiei Genetice, analiza căilor și tehnici de învățare automată. Metodele sunt ilustrate cu exemple concrete și date reale, iar codul R pentru toate rutinele este disponibil pe un CD-ROM însoțitor.

Cu toate premisele necesare incluse, această carte best-seller ghidează studenții de la noțiuni foarte elementare la tehnici avansate de analiză în R și Bioconductor. Prima jumătate a textului prezintă o prezentare generală a microarray-urilor și a elementelor statistice care formează elementele de bază ale oricărei analize de date. A doua jumătate introduce tehnicile cele mai frecvent utilizate în analiza datelor microarray.