Studiu bioinformatic al elementelor potențial implicate în răspunsul la lumină la Metarhizium

Recenzii ale cititorilor

În prezent, nu există recenzii ale cititorilor. Evaluarea se bazează pe 2 voturi.

Titlul original:

Bioinformatics study of elements potentially involved in response to light in Metarhizium

Conținutul cărții:

Lumina este unul dintre factorii abiotici constanți de pe planetă și practic toate organismele vii prezintă un anumit tip de răspuns la stimulul luminos. Un aspect important după receptarea luminii este modularea genelor; acest mecanism implică stimularea sau inhibarea expresiei anumitor gene care, posibil, au ca scop adaptarea la diferite condiții de mediu. La ciuperci, răspunsul la lumină are un efect foarte important asupra genelor implicate în reglarea circadiană; în acest proces, produșii genelor frq și frh reglează activitatea complexului gulerului alb (WCC) într-un mod dependent de timp.

Acest fenomen este studiat pe scară largă la organismele saprofite, însă studiul componentelor moleculare și al mecanismelor implicate în cronobiologie și fotobiologie la ciupercile entomopatogene este relativ nou. La Metarhizium există rapoarte privind efectele fenotipice cauzate de stimulul luminos, inclusiv creșterea în lumină constantă sau fotoperioadă; însă nu există o descriere completă a mecanismului care conduce la aceste caracteristici fenotipice fotodependente.

Pe baza distribuției largi a genelor de răspuns la lumină în ciupercile filamentoase, am efectuat o analiză bioinformatică a contextului subgenomic al genelor respective utilizând software-ul Mauve și RStudio. Am constatat că genele de răspuns la lumină par să fie constante în genomurile analizate, demonstrând o conservare microsintenică în cadrul genului Metarhizium, cu excepția genei wc2. Pentru a înțelege mai bine posibila reglementare transcripțională, am analizat promotorii genelor de răspuns la lumină, căutând elemente cis-regulatoare putative, găsind motive conservate în toate speciile de Metarhiuzm analizate; această abordare ne-a permis să identificăm alte posibile gene de răspuns la lumină și de control circadian în cadrul genomului acestui gen.

În cele din urmă, propunem diferite mecanisme dependente de lumină, în plus față de componentele moleculare putative și genele implicate în aceste fenotipuri caracteristice.