Bioinformatică cu cartea de bucate Python

Recenzii ale cititorilor

Cartea este o resursă cuprinzătoare pentru cei din domeniul biologiei computaționale, subliniind în special aplicațiile practice ale Python în bioinformatică. Ea acoperă o varietate de subiecte, inclusiv secvențierea următoarei generații, genetica populației și structura proteinelor, oferind exemple de cod și explicații. Cu toate acestea, necesită o înțelegere medie spre înaltă a Python și o anumită familiaritate cu terminologia bioinformatică.

⬤ Acoperire cuprinzătoare a diferitelor domenii din biologia computațională.
⬤ Oferă sfaturi practice de programare Python și exemple de cod.
⬤ Conținut actualizat și bine structurat.
⬤ Prezentare clară și concisă a materialelor.
⬤ Potrivit pentru utilizatorii intermediari până la avansați în bioinformatică.

⬤ Necesită cunoștințe prealabile de Python și terminologie bioinformatică.
⬤ Nu este potrivit pentru începători în Python sau bioinformatică.
⬤ Capitolul 1 privind instalarea software-ului poate fi considerat inutil de către unii utilizatori cu cunoștințe anterioare.

(pe baza a 6 recenzii ale cititorilor)

Titlul original:

Bioinformatics with Python Cookbook

Conținutul cărții:

Aflați cum să utilizați bibliotecile și aplicațiile bioinformatice Python moderne pentru a face cercetare de vârf în biologia computațională

Despre această carte

Descoperiți și învățați cele mai importante biblioteci și aplicații Python pentru a face o analiză bioinformatică complexă Se concentrează pe cele mai moderne instrumente pentru a face cercetare cu secvențierea de generație următoare, genomică, genetica populației, filogenomică și proteomică Utilizează exemple din lumea reală și vă învață să implementați metode de cercetare cu impact ridicat

Pentru cine este această carte

Dacă aveți cunoștințe de nivel mediu de Python și cunoașteți bine principalele cercetări și vocabularul din domeniul bioinformatic care vă interesează, această carte vă va ajuta să vă dezvoltați cunoștințele în continuare.

Ce veți învăța

Veți dobândi o înțelegere profundă a bibliotecilor bioinformatice fundamentale din Python și veți fi expus la cele mai importante instrumente de știința datelor din Python Procesați date la nivel de genom cu Biopython Analizați și efectuați controlul calității pe seturile de date de secvențiere de generație următoare utilizând biblioteci precum PyVCF sau PySAM Utilizați DendroPy și Biopython pentru analiza filogenetică Efectuați analize de genetică a populației pe seturi mari de date Simulați demografii complexe și caracteristici genomice cu simuPOP

În detaliu

Dacă sunteți un biolog computațional sau un programator Python, probabil că vă veți referi la expresia „creștere explozivă, vremuri interesante”. Python este, fără îndoială, principalul limbaj de programare pentru big data, iar avalanșa de date din biologie, în principal din genomică și proteomică, face din bioinformatică unul dintre cele mai interesante domenii din știința datelor.

Folosind rețetele practice din această carte, veți putea să faceți cercetare și analiză practică în biologia computațională cu Python. Acoperim biblioteci moderne, de secvențiere de generație următoare și explorăm exemple reale despre cum să gestionați date reale. Obiectivul principal al cărții este aplicarea practică a bioinformaticii, dar acoperim, de asemenea, tehnici și cadre de programare moderne pentru a face față avalanșei tot mai mari de date bioinformatice.